- Комплекс SCF
-
Ко́мплекс SCF (аббревиатура слагается из начальных букв трёх субъединиц комплекса: Skp1, Cul1, F-box) — белковое соединение, играющее существенную роль в регуляции клеточного цикла. В структуре комплекса прежде всего выделяют ядро, состоящее из трёх субъединиц: структурообразующего белка куллина, каталитичексого RING-домена и адапртоного белка. Через RING-домен с ядром комплекса SCF соединяется убиквитин-конъюгирующий фермент, который обеспечивает перенос молекулы убиквитина на белок-мишень. Через адапторный домен с комплексом SCF соединяется субстрат-специфичный домен, обеспечивающий связывание целевого белка.[1]
Функционально комплекс SCF представляет собой убиквитинлигазу и катализирует убиквитин-зависимый протеолиз белков-мишеней. На протяжении всего клеточного цикла ядро комплекса SCF пребывает в активном состоянии,[1][2] но активность всего комплекса целиком регулируется двумя факторами. Во-первых, присоединением соответствующего субстрат-специфичного домена, распознающего и связывающего целевые белки. Во-вторых, в большинстве случаев, мишени комплекса SCF должны быть фосфорилированы, для их распознавания субстрат-специфичным доменом.[1][3]
Важную роль комплекс SCF играет при переходе клетки из S-фазу. На данном этапе SCF обеспечивает убиквитинирование и последующий протеолиз ингибиторов циклин-зависимых киназ,[4] что ведёт к образованию циклин-киназных комплексов G1/S-Cdk, которые в свою очередь обеспечивают G1/S-переход.[3]
Ещё одной установленной функцией комплекса SCF является участие в регуляции M-фазы. На данном этапе SCF, во-первых, убиквитинирует протеинкиназу Wee1, способствуя тем самым активации митотических циклин-киназ M-Cdk. Во-вторых, SCF убиквитинирует Emi1 — белок-ингибитор комплекса APC, обеспечивая переход клетки в анафазу митоза.[3]
Содержание
Строение и классификация
В структуре комплекса SCF прежде всего выделяют ядро, состоящее из трёх субъединиц: структурообразующего белка куллина, каталитичексого RING-домена и адапртоного белка. Через RING-домен с ядром комплекса SCF соединяется убиквитин-конъюгирующий фермент (E2), который обеспечивает перенос молекулы убиквитина на белок-мишень. Через адапторный домен с комплексом SCF соединяется субстрат-специфичный домен, обеспечивающий связывание целевого белка.[1]
Аббревиатура SCF слагается из начальных букв трёх субъединиц комплекса: Skp1 (англ. S-phase kinase-associated protein 1 — «белок ассоциированный с киназами S-фазы 1»), Cul1 (англ. cullin 1 — «куллин 1»), F-бокс (англ. F-box).[1]
На основании структурных различий выделяют как минимум три типа комплексов SCF: SCF1, SCF2 и SCF3. Порядковые номера служат для обозначения соответствующего куллина, входящего в состав SCF: Cul1, Cul2 или Cul3. Помимо этого все три комплекса SCF различаются адапторными доменами: для SCF1 — это Skp1, для SCF2 — EloB/C (англ. elongin B/C — «элонгин B/C»), а в комплексе SCF3 субстрат-специфический домен (BTB или POZ) контактирует непосредственно с субъединицей куллина Cul3, то есть выполняет одновременно субстрат-связующую и адапторную функцию. Каждая группа SCF также различается характерным типом субстрат-специфического домена: для SCF1 — это белки группы F-box, для SCF2 — белки группы BC-box, для SCF3 — домены BTB/POZ (англ. BTB — broad complex/tramtrack/bric-a-brac; POZ — poxvirus zinc finger protein — «цинкосодержащий пальцевидный белок поксвируса»). Единственным общим элементом для всех трёх типов SCF является RING-домен — Rbx1 (англ. RING box protein-1 — «белок RING-бокс 1»), также называемый Roc1 (англ. regulator of cullins-1 — «регулятор куллинов 1»).[5][6]
Типология комплексов SCF[6] Тип SCF SCF (SCF1) SCF2/5 SCF3 SCF4 SCF7 Куллин Cul1/Cdc53 Cul2 или Cul5 Cul3 Cul4 (4A, 4B) Cul7 RING-домен Rbx1/Roc1/Hrt1 Rbx1/Roc1/Hrt1 Rbx1/Roc1/Hrt1 Rbx1/Roc1/Hrt1 Rbx1/Roc1/Hrt1 Адапторный домен Skp1 Элонгин C, элонгин B BTB/POZ ? Skp1 Субстрат-специфичный домен F-box (Skp2, Cdc4 и др.) BC-box (SOCS box) BTB/POZ ? F-box (Fbw29) Функции
Комплекс SCF относится к подподклассу ферментов убиквитинлигаз и катализирует реакции убиквитинирования — ковалентного присоединения молекул убиквитина к целевым белкам. При этом маркированные в результате убиквитинирования целевые белки распознаются и расщепляются в 26S протеасомах. Распознавание целевых белков обеспечивает субстрат-специфичный домен в совтаве комплекса SCF.[1][7]
Несмотря на структурное разнообразие SCF-подобных комплексов, пока остаётся неизвестной роль большинства из них. Фактически установлена роль лишь для комплексов группы SCF1 (Skp1-Cul1-Rbx1-F-box).[5] При этом даже в пределах группы SCF1 насчитывается порядка 70 различных субстрат-специфичных доменов F-box, о функциях которых, в большинстве случаев, также пока мало известно.[2]
Главной установленной функцией комплекса SCF является участие в регуляции клеточного цикла. Реализация данной функции обеспечивается соответствующими субстрат-специфичными доменами группы F-box: Skp2 (англ. S-phase kinase-associated protein 2 — «белок ассоциированный с киназами S-фазы 2»), Fbw7 (англ. F-box and WD repeat domain-containing 7 — «домен F-бокс, содержащий WD-повтор 7»), β-TRCP (англ. beta-transducin repeat containing protein — «белок, содержащий повторные участки бета-трансдуцина»).[2] Домен Skp2 позволяет комплексу SCF контролировать активность следующих регулятовров клеточного цикла: циклина D1, циклина E, p130Rb2, E2F1, а также активность группы ингибиторов циклин-зависимых киназ — p27kip1 (p27), p21Waf1/Cip1/Sdi1 (p21), p57kip2 (p57). С участием домена Fbw7 обеспечивается контроль регуляторов: c-myc, Jun, циклина E, Notch. Домен β-TRCP даёт контроль над двумя важными регуляторами активности митотических циклин-зависимых киназ — киназой Wee1 и фосфатазой Cdc25. Помимо этого β-TRCP контролирует активность бета-катенина и Emi1.[2]
В течение интерфазы комплекс SCF регулирует активность следующих субстратов: Cdc25A; циклина D1; циклина E; циклин-зависимой киназы 2 (Cdk2); фактора репликации ДНК — Cdt1; белка p130; ингибиторов циклин-зависимых киназ — p21, p27, p57; транскрипционного фактора E2F1. Важную роль комплекс SCF играет при переходе клетки из фазы G1 в S-фазу. На данном этапе SCFSkp2 обеспечивает убиквитинирование и последующий протеолиз ингибиторов циклин-зависимых киназ,[4] что ведёт к образованию циклин-киназных комплексов G1/S-Cdk, которые в свою очередь обеспечивают G1/S-переход. По окончании перехода из G1-фазы в S-фазу G1/S-циклины (циклин E, циклин D1) разрушаются при участии комплекса SCF.[3]
Вторым важным участком, на котором тоже реализуются функции комплекса SCF, является M-фаза. На данном этапе SCFβ-TRCP, во-первых, убиквитинирует протеинкиназу Wee1, способствуя тем самым активации митотических циклин-киназ M-Cdk. Во-вторых, SCFβ-TRCP убиквитинирует Emi1 — белок-ингибитор комплекса APC, обеспечивая переход клетки в анафазу митоза.[3]
Регуляция
На протяжении всего клеточного цикла ядро комплекса SCF пребывает в активном состоянии,[1][2] но активность всего комплекса целиком регулируется двумя факторами. Во-первых, присоединением соответствующего субстрат-специфичного домена, распознающего и связывающего целевые белки. Во-вторых, в большинстве случаев, мишени комплекса SCF должны быть фосфорилированы, для их распознавания субстрат-специфичным доменом.[1][3]
В плане регуляции стоит также отметить взаимодействие комплекса SCF с ещё одной регуляторной убиквитинлигазой клеточного цикла — комплексом стимуляции анафазы (англ. APC).
Обе убиквитинлигазы — SCF и APC — могут контролировать активность одних и тех же субстратов. Например, у делящихся дрожжей циклин S-фазы (Cig2) контролируется и со стороны APC, и со стороны SCFPop1/2.[4] В клетках человека, сходный двусторонний контроль наблюдается применительно к фосфатазе Cdc25A. На протяжении фазы G1 активность Cdc25A сдерживается комплексом APCCdh1. После этого, в S-фазе клеточного цикла, SCFβ-TRCP контролирует активность Cdc25A в зависимости от наличия повреждений ДНК.[4][8]
Ещё одной особенностью SCF и APC является взаимозависимая регуляция активности обоих убиквитинлигаз. В течение фазы G1 комплекс APCCdh1 участвует в убиквитинировании субстрат-распознающей субъединицы Skp2, тем самым достигается сдерживаение активности комплекса SCF. Далее, при переходе клетки из фазы G1 в S-фазу, активированный комплекс SCFSkp2 обеспечивает убиквитинирование и последующий протеолиз ингибиторов циклин-зависимых киназ, что ведёт к образованию циклин-киназных комплексов G1/S-Cdk (например, циклин A-Cdk2). Активированные циклин-киназы G1/S-Cdk фосфорилируют субъединицу Cdh1, деактивируя, таким образом, комплекс APC. Наконец, в ранней M-фазе SCFβ-TRCP инициирует протеолиз Emi1 — белка-ингибитора субъединицы Cdc20, которая входит в состав комплекса APCCdc20. Удаление ингибитора Emi1 обеспечивает активацию комплекса APC.[9]
Примечания
- ↑ 1 2 3 4 5 6 7 8 Morgan D. O., 2007, p. 47
- ↑ 1 2 3 4 5 Fasanaro et al., 2010, p. 273
- ↑ 1 2 3 4 5 6 Role of SCF complex in cell cycle regulation (англ.). Архивировано из первоисточника 8 октября 2012. Проверено 29 октября 2012.
- ↑ 1 2 3 4 Vodermaier, 2004, p. R791
- ↑ 1 2 Vodermaier, 2004, p. R788
- ↑ 1 2 Passmore, Barford, 2004, p. 519
- ↑ Fasanaro et al., 2010, p. 272
- ↑ Multiple E3 ubiquitin ligases, checkpoint kinases, and the deubiquitylating enzyme Dub3 control Cdc25A stability and activity during the cell cycle (англ.). Архивировано из первоисточника 8 октября 2012. Проверено 29 октября 2012.
- ↑ Fasanaro et al., 2010, p. 275
Литература
- Morgan D. O. The cell cycle: principles of control. — New science press, 2007. — 297 p. — ISBN 978-0-9539181-2-6
- Lori A. Passmore, David Barford. Getting into position: the catalytic mechanisms of protein ubiquitylation (англ.) // Biochemical Journal. — 2004. — № 379. — P. 513—525. — DOI:10.1042/BJ20040198
- Hartmut C. Vodermaier. APC/C and SCF: controlling each other and the cell cycle (англ.) // Current Biology. — Elsevier Ltd., 2004. — Vol. 14. — P. R787—R796. — DOI:10.1016/j.cub.2004.09.020
- Pasquale Fasanaro, Maurizio C. Capogrossi, Fabio Martelli. Regulation of the endothelial cell cycle by the ubiquitin-proteasome system (англ.) // Cardiovascular Research. — 2010. — № 85. — P. 272—280. — DOI:10.1093/cvr/cvp244
Клеточный цикл Фазы Интерфаза S-фаза · G2-фаза M-фаза Митоз (Препрофаза · Профаза · Прометафаза · Метафаза · Анафаза · Телофаза) · Цитокинез Другие фазы Апоптоз · Мейоз Контрольные точки Точка рестрикции · Точка веретена · Пострепликационная точка Регуляторы Циклины A · B · D · E Циклин-зависимые киназы 2 · 3 · 4 · 5 · 6 · 7 · 8 · 9 · 10 · Cdk-активирующая киназа Убиквитинлигазы Комплекс стимуляции анафазы · Комплекс SCF Ингибиторы Cdk Cip/Kip (p21, p27, p57) · INK4 (p15, p16, p18, p19) Другие Cdc2 · Cdc25 · Cdc42 · Клеточный белок предрасположенности к апоптозу · E2F · Фактор ускорения созревания · Wee Категория:- Клеточный цикл
Wikimedia Foundation. 2010.