Международный комитет по таксономии вирусов

Международный комитет по таксономии вирусов (англ. International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV — занимается организацией таксономической классификации вирусов^[1]. ICTV была разработана универсальная система таксономии для описания всех существующих вирусов. Члены комитета являются признанными мировыми экспертами в области вирусологии^[2]. Комитет организован и управляется Отделением Вирусологии International Union of Microbiological Societies. Разделение видов внутри семейств производится отдельными исследовательскими группами, в которых входят эксперты по данным семействам^[1].

Комитет также разрабатывает базу данных (ICTVdB), в которой содержится информация о таксономическом положении более чем 2000 видов вирусов^[1]. База данных открыта для свободного доступа.

Цели

Официально целями ICTV являются:

1. Разработка международно признанной таксономической системы для вирусов
2. Разработка международно признанных названий для таксонов вирусов, в том числе, отдельных видов и субвирусных агентов
3. Ознакомление об изменениях в таксонах вирусов, в том числе, международным сообществам вирусологов и публикация в интернете
4. Поддержка списка названий вирусов
5. Поддержка базы данных ICTV в сети интернет, в которой содержится информация о каждом таксоне, а также названия всех таксонов на всех основных языках

Номенклатура

Основные принципы ICTV номенклатуры вирусов:

• Стабильность
• Избегать или ограничивать использование названий, которые могут вызвать ошибки или путаницу
• Избегать создание избыточных названий

Универсальная классификация вирусов, созданная ICTV, использует немного измененную систему биологической систематики. Используются следующие таксоны: отряд, семейство, подсемейство, род и вид. В случае, когда отнесение вида к роду неоднозначно, но принадлежность к семейству не вызывает сомнений, вирус относят к неопределенному роду семейство^[1].

Стабильность систематики вирусов по версии ICTV очень высока. Каждый род и каждый вид, существовавший в 1980-х, существовал по крайней мере до 2005 года^[1].

Названия и изменения таксонов

Предложения о новых названиях, изменениях названий и установлении таксонов обрабатываются исполнительным комитетом ICTV.

Название таксона должно быть утверждено ICTV, названия принимаются лишь в случае, когда установлена связь между вышестоящими таксонами. Если для таксона не предложено подходящего имени, таксон может оставаться неназванным до принятия приемлемого международного названия.

Правила именования

Для видов

Название виду подбирают из максимально возможно коротких, название вида должно однозначно характеризовать вид и отличать его от других видов. Цифры, буквы или их комбинации могут быть использованы в качестве видовых эпитетов. Однако только последовательности букв или цифр не могут являться видовыми эпитетами. При описании новых видов, нумерация может быть продолжена.

Для родов

К одному роду вирусов относят виды, сходные по некоторым важным свойствам, часто отличающихся либо в хозяине, либо в вирулетности. Название рода оканчивается на virus. Принятие нового рода сопровождается подбором типового вида.

Для подсемейств

Подсемейство — это группа родов, имеющих общие признаками. Таксон подсемейство используется для разрешения сложных иерархических структур. Название подсемейства оканчивается на virinae.

Для семейств

Семейство — это группа родов, которые либо не упорядоченных или нет в подсемейства, имеющих общие признаки, название оканчивается на viridae.

Для отрядов

Отряд — это группа семейств с некоторыми общими характеристиками, название оканчивается на virales.

Орфография

1. Названия отрядов, семейств, подсемейств и родов вирусов пишут курсивом, с заглавной буквы
2. Названия видов пишут курсивом, первое слово в названии — с заглавной буквы, все другие слова пишут со строчной буквы, кроме собственных имен существительных
3. Обычно перед названием таксона пишут ранг таксономической единицы

Десятичный код

Классификация ICTV использует восемь положений десятичного кода для обозначения отряда, семейства, подсемейства, рода, вида, серотипа или подтипа, штамма или изолята. Каждое положение кода использует от одной до трех цифр. Десятичный код идентифицирует вирус до уровня штамма или изолята.

Описание и примеры таксономии

Таксон	Код	Название
Poliovirus-1 Brunhilde
Отряд	00.
Семейство	00.052.	Picornaviridae
Подсемейство	00.052.0.
Род	00.052.0.01.	Enterovirus
Вид	00.052.0.01.007.	Poliovirus 1
Подвид	00.052.0.01.007.00.
Серотип	00.052.0.01.007.00.001.	Poliovirus 1
Штамм или изолят	00.052.0.01.007.00.001.001.	PV-1 Brunhilde
Influenza A virus, A/Puerto Rico/8/34 (H1N1) isolate
Отряд	00.
Семейство	00.046.	Orthomyxoviridae
Подсемейство	00.046.0.
Род	00.046.0.01.	Influenzavirus A
Вид	00.046.0.01.001.	Influenza A virus
Подвид	00.046.0.01.001.00.
Серотип	00.046.0.01.001.00.001.	H1N1
Штамм или изолят	00.046.0.01.001.00.001.001.	A/Puerto Rico/8/34

База данных

Разработка ICTVdB поддерживается ICTV с 1991 года, и была изначально предназначена для поддержания таксономических исследований. База данных классифицирует вирусы по химическим характеристикам, типу генома, особенностям репликации нуклеиновой кислоты, заболеваниям, векторам заражения, географическому распределению.

См. также

• Вирусология
• Шаблон:ICTVdB для создания ссылок на базу данных ICTVdB

Примечания

1. ↑ ^{1 2 3 4 5} Fauquet CM, Fargette D (2005). «International Committee on Taxonomy of Viruses and the 3,142 unassigned species». Virol. J. 2: 64. DOI:10.1186/1743-422X-2-64. PMID 16105179.
2. ↑ The origin of ICTVdB, webpage, retrieved 22nd June 2006

Внешние ссылки

• Сайт ICTV, база данных ICTVdB